大约在7世纪,道教神仙长生思想和方术即已传往日本。日本留学生曾在中国学习道教方技,并把道教经典带回日本。从平安时代起,道教守庚申的信仰在日本颇为流行。(道教称人身中有三尸虫(彭踞、彭踬和彭蹻),每逢庚申日,待人熟睡之时,就会到天庭上告人之罪过,折人寿数。因此,学道之人逢庚申日就要彻夜不眠,不让三尸虫出去,称为「守庚申」。)到了15世纪,道教劝善书《太上感应篇》在日本流传开来。在日本冲绳县,至今还保存著一些民间道教信仰,如供奉灶神、土地神、城隍神以及妈祖、关帝等。
现在,除华人在函馆、横滨、大阪、神户、长崎等地建有关帝庙外,日本人也兴建了一些道教宫观。在东京西部大岳山上有座多摩道院,代表人物是笹目秀。东京还有一个仙道连,创立人是田中教夫。仙道连以不老不死的仙境作为理想。田中教夫曾在北京白云观修行。福岛县有一座名为「池拔利」(音译)的道观,创始人是早岛正雄。他自称曾在台湾学道,为龙门派第十三代传人。1991年,早岛正雄率领一个由124名日本道教信徒组成的朝圣团,前来北京白云观拜祖朝圣。白云观经师为日本道友举行了「祈福消灾延寿法会」,并向每一个日本道友赠送了道服、道巾。近年来,已有数百位日本道教信徒来中国朝祖拜圣。